AgroGenDetec: Nuevo método para la detección e identificación de patógenos en etapas tempranas de infección de cultivos con interés agroindustrial (CPP2021-008989)
Grupo de Enzimología, Biorremediación de Suelos y Residuos Orgánicos
Las enfermedades producidas por patógenos de plantas, especialmente patógenos fúngicos, tienen un gran impacto en la agricultura y su economía derivada, así como en el manejo de los recursos naturales. El movimiento de germoplasma y cualquier otro material vegetal para uso en agricultura, ornamentación y silvicultura puede implicar un gran riesgo de propagación de enfermedades y plagas.
El logro del proyecto actual tiene como objetivo desarrollar un nuevo método para la detección e identificación de patógenos fúngicos en infecciones en etapas tempranas mediante la caracterización de la «huella genética» de elementos moleculares que regulan la interacción específica planta-patógeno. Esta huella se basa en pequeños ARN no codificantes (sncRNA) encargados de regular este proceso. Actualmente no existe una herramienta molecular similar capaz de realizar la detección e identificación de patógenos durante las etapas más tempranas de las infecciones. El desarrollo de esta herramienta molecular permitirá dotar al sector Agroalimentario de capacidad de decisión para aplicar medidas tempranas de cuarentena, contención y/o tratamiento de la infección en diferentes cultivos, i) cuando la infección aún no está fenotípicamente desarrollada en el cultivo, y ii) en un tiempo efectivo reduciendo enormemente (y en muchos casos totalmente) las posibles pérdidas económicas debidas a un amplio espectro de infecciones provocadas por patógenos en múltiples cultivos protegiendo la agricultura y la industria agroalimentaria.
Este proyecto se desarrollará a través de un enfoque multidisciplinar, teniendo un carácter muy innovador desde varios puntos de vista:
- Este nuevo método se basa en el papel fundamental de los sncRNAs que juegan durante la patogénesis de la enfermedad tras la invasión de hongos en las plantas al interactuar con diferentes clases de genes de resistencia. Existe un patrón de expresión diferencial de los sncRNAs debido principal y específicamente a los tipos de especies vegetales y la especificidad de los patógenos y sus especies específicas, respectivamente del patógeno y en cada cultivo. Esta gran especificidad se debe a que, ante una infección, y como mecanismo de defensa, cada hongo patógeno ha desarrollado la capacidad de manipular la red reguladora de defensa de las plantas;
- Metodológicamente, utiliza técnicas de última generación muy eficientes basadas en la secuenciación de última generación (NGS de alto rendimiento), metodologías bioinformáticas avanzadas, el desarrollo de pruebas de detección basadas en la relación estructura funcional-secuencia de los sncRNAs, entre otras.
Socios: MICROGAIA, SYNTECH y Estación Experimental del Zaidín.
Presupuesto concedido al CEBAS: 64.864,70 €
Duración: 01/09/2022– 30/08/2024
